Selvejende institutioner der er optaget med en driftsbevilling på bevillingslovene på lige fod med de egentlige statsinstitutioner er omfattet af de samme systemkrav som statsinstitutionerne, jf. § 11 stk. 1 og 2 i regnskabsbekendtgørelsen.
Disse institutioner skal derfor anvende de basissystemer, som Moderniseringsstyrelsen stiller til rådighed på økonomi-, betalings- og lønområdet.
De skal endvidere anvende Statens Koncernsystem (SKS).